• תוכניות "שרתי לך ארצי" (1974-1976):
  • על התוכנית בויקיפדיה
  • קישור לכל התוכניות
• תוכניות "על הדשא" (סוף שנות ה-70)
• אליהו הכהן בתוכנית "סיבה למסיבה" (1989)
• ערב ללוין קיפניס (2000)
• :"על הררי ציון" - בחיפוש אחר המנון לאומי (2007)
• "כך היה" עם יגאל רביד (2008)
• שימור המורשת הצלילית (2009)
• ערב לאברהם צבי אידלזון (2010) - חלק א', חלק ב'
• אירוע הוקרה לאליהו הכהן (2010)
• טקס הסרת הלוט משלט ההנצחה לחנינא קרצ'בסקי (2011)
• טקס הסרת הלוט משלט ההנצחה לפואה גרישנפון (2012)
• אליהו הכהן על שלמה קפלן (2012)
• אליהו הכהן על דן אלמגור (2012)
• שלום פוסטולסקי ומשה ביק (2012) - חלק א', חלק ב'
• על מנצח המקהלות שלמה קפלן (2012)
• על דן אלמגור (2012)
• גלגולו של המנון התקווה (2013)
• סיפורים קצרים (2013)
• "היו ימים" עם ד"ר תום שגב (2013)
• פגישות עם אורלנד (2014)
• "מחברת שירי ילדותי" (2015)
• חברים מספרים אליהו הכהן (2018) - חלק א', חלק ב'
• באר אורה של אליהו הכהן (2021)

 להאזנה

• "מי יודע" - שירי ירושלים (1965)
• "מי יודע" - ההמנון הלאומי (1965)
• זה קרוב ללבי (1970)
• בארץ חמדת אבות (1972)
• שוב יוצא הזמר - חנוכה (1977)
• עשור לפטירתו של מרדכי זעירא (1978)
• אליהו הכהן בתוכניות "נתיב הזמר" (1991-1992)
• שירים למאיר נוי (1998)
• אליהו הכהן על המלחין אברהם מינדלין (2014)
• דן אלמגור על אליהו הכהן (2014)

לקריאה

מאמרים:

• "השפן הקטן" (2006)
• סיפורו של שיר "השבועה" (2007)
• "נרותיי הזעירים (2007)
• "לילה, דממה" (2008)
• "נבנה ארצנו" - השיר ויוצרו (2008)
• שירי אגודת הבריאות (2008)
• פזמוניה הראשונים של לאה גולדברג - חלק ב' (2009)
• מִנִּי דָן עַד בְּאֵר שֶׁבַע (2010)
• "את חכי לי ואחזור" - חלק א', חלק ב', חלק ג' (2010)
• דברים בטקס אות הוקרה על מפעל חיים (2010)
• דברים לזכרו של עמנואל זמיר (2012)
• דרכה האחרונה של אסתר גמליאלית (2012)
• אליהו הכהן מקבל את פרס ישראל (2013)
• "טוב לחיות בעד ארצנו" - שיר נשכח מלפני 100 שנה (2015)
• הוא היה הראשון: על המוזיקאי צבי ניסן גולומב (2015)
• על השיר "ציון, ציון, עיר אלוהינו" (2017)
• 'אֵלֶיךָ אָבִינוּ': תפילה לשלום הנדיב הידוע (2017)
• חמש שנים על מיכאל עברו בגלגולים (שנה לא ידועה)
• כיצד נולד השיר 'חמש שנים על מיכאל (2017)
• שירי הזמר העבריים של אליקום צונזר - חלק א', חלק ב' (2018)
• שירי זמר לעידוד הדיבור בעברית (2018)
• 'מנגינות עבריות' של לורד ביירון (2018)
• 'לי עֵז קטנה': יצחק אפשטיין ותרומתו לשירי הילדים בעברית (2018)
• צִיּוֹן תַּמָּתִי, צִיּוֹן חֶמְדָּתִי: שירי הזמר של מנחם מנדל דוליצקי - חלק א', חלק ב' (2019}
• שובו, שובו ממרחקים: גלגוליו של השיר 'שאו ציונה נס ודגל'  - חלק א', חלק ב' (2020)
• שירי הערש בימי העלייה הראשונה: נומה פרח, בני מחמדי (2021)
• באר אורה של אליהו הכהן (2021)
• 'עַם עוֹלָם': גלגוליו של שיר שנחבא (2022)
• "שנה הלכה, שנה באה" - גלגולו של שיר ילדים לראש השנה (2022)
• השיר הכי אהוב: ערב בגליל (2023)

ספרים ופרסומים:

• 100 שירים שרנו לך ארץ ישראל, חוברת שירים, עורכי החוברת - דן אלמגור, אליהו הכהן, עריכה גרפית - אלדד זקוביץ, מעריב, תל אביב, תשל"ה-1975
• זמר לך מכורתי, שירי ארץ ישראל, ערך אליהו הכהן, ידיעות אחרונות, תל אביב, תשמ"ב-1982
• בכל זאת יש בה משהו, עם תווים, שירי הזמר של תל אביב בצליל, באומר ובתמונה, עם חג השבעים וחמש לייסודה, סיפר, עיטר וערך אליהו הכהן, דביר, ירושלים, תשמ"ה-1985
• מאתיים שנות המקראה העברית, 1789–1988, תערוכה וקטלוג, מאוספו ובעריכתו של אליהו הכהן, תל אביב, המכללה לחינוך ע"ש לוינסקי-מרכז לוין קיפניס לספרות ילדים, תשמ"ח-1988
• לילה, לילה, משירי המלחין מרדכי זעירא, עורך - גיל אלדמע, מבוא ופרטי מידע - אליהו הכהן, 1998
• לוין קיפניס - ביבליוגרפיה, בעריכת אליהו הכהן, תל אביב, מרכז לוין קיפניס לספרות ילדים - מכללת לוינסקי לחינוך, תשנ"ט-1999
• שיר מזמור לתל אביב, עם תווים, לקט פזמונים ושירים ששרו בתל אביב לתקופותיה, ליקט הסביר וההדיר אליהו הכהן, בנק לאומי תל אביב
• עשר השנים הראשונות - משירי ירושלים בראשית תקופת המנדט תרע"ח-תרפ"ח, ירושלים בתקופת המנדט, תשס"ג-2003
• מדריכי ארץ ישראל הראשונים, בשיתוף עם אלי שילר, הוצאת אריאל, 2016
• 'אהבת ציון', מכמנים בידיעת הארץ, הוצאת אריאל, 2017
• ירושלים בזמר העברי בתקופת היישוב, הוצאת אריאל, 2018
• מסעו של ואן דה ולדה לארץ ישראל (1852), הוצאת אריאל, 2018.
• "על הררי ציון, בחיפוש אחר המנון לאומי", בספר: יפה ברלוביץ ויוסף לנג (עורכים), לשוחח תרבות עם העלייה הראשונה, הוצאת הקיבוץ המאוחד, 2010, עמ' 223–247. גרסה מקוונת של הספר (לבעלי הרשאה), באתר "כותר"
• התקליט העברי - סיבובים ראשונים", פרקים בדיסקוגרפיה של הזמר העברי, בספר: יאיר סתוי ויוסי מר חיים (עורכים),הכל זהב, הוצאת מעריב, 1993
• דוד אסף‏, פרסומי אליהו הכהן בבלוג עונג שבת: ביבליוגרפיה מקוונת, בבלוג "עונג שבת", 17 בנובמבר 2023

על המנון התקווה:

• "מי יודע" - ההמנון הלאומי (1965)
• "התקווה", סיפורו של המנון ("גיתית" דו ירחון למוסיקה, סיון תשכ"ח)
• "כיצד הפכה התקווה להמנון" ("עתמול", נובמבר 1978)
• כיצד הפכה "התקווה" להמנון (מאמר, 1997)
• "על הררי ציון" - בחיפוש אחר המנון לאומי (הרצאה מצולמת, 2007)
• "עוד לא אבדה תקוותנו" - "התקווה" - משיר להמנון (מאמר, 2008)
• "עוד לא אבדה תקוותנו" ("אריאל" 186, ינואר 2009, עמ' 101 עד 104, זמין מקוון במאגר "כותר ספרי עיון", במנוי בלבד)
• על הררי ציון – בחיפוש אחר המנון לאומי" (בתוך הספר "לשוחח תרבות עם העלייה הראשונה" בעריכת יפה ברלוביץ ויוסף לנג, הוצאת הקיבוץ המאוחד, עמ' 223-247, 2010, זמין במנוי במאגר "כותר ספרי עיון", במנוי בלבד)
• גלגולו של המנון התקווה (ריאיון טלוויזיה, 2013)